Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChukQ60680 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChukQ60680 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChukQ60680 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChukQ60680 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChukQ60680 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChukQ60680 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChukQ60680 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChukQ60680 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChukQ60680 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChukQ60680 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChukQ60680 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChukQ60680 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChukQ60680 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChukQ60680 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms