Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a4Q5XF90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a4Q5XF90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a4Q5XF90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Atp13a4Q5XF90 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a4Q5XF90 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms