Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim38Q5SZ99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim38Q5SZ99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim38Q5SZ99 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim38Q5SZ99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
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