Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc1Q5NCF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc1Q5NCF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms