Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Trim41Q5NCC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Trim41Q5NCC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Trim41Q5NCC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Trim41Q5NCC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Trim41Q5NCC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Trim41Q5NCC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Trim41Q5NCC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Trim41Q5NCC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms