Protein–RNA interactions for Protein: Q4PLS0

Nlrp2, NACHT, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp2Q4PLS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp2Q4PLS0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp2Q4PLS0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp2Q4PLS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp2Q4PLS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp2Q4PLS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp2Q4PLS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp2Q4PLS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nlrp2Q4PLS0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp2Q4PLS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms