Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt2Q497M0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samt2Q497M0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt2Q497M0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samt2Q497M0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms