Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa20Q45VN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa20Q45VN2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms