Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm906Q3V0M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm906Q3V0M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm906Q3V0M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms