Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd42Q3V096 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd42Q3V096 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd42Q3V096 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd42Q3V096 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350.5 ms