Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bbof1Q3V079 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bbof1Q3V079 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bbof1Q3V079 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms