Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxred2Q3USW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxred2Q3USW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxred2Q3USW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxred2Q3USW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxred2Q3USW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms