Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm20Q3UQS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm20Q3UQS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm20Q3UQS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm20Q3UQS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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