Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mindy4Q3UQI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mindy4Q3UQI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mindy4Q3UQI9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mindy4Q3UQI9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms