Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cobll1Q3UMF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cobll1Q3UMF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cobll1Q3UMF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cobll1Q3UMF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms