Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smcr8Q3UMB5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smcr8Q3UMB5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smcr8Q3UMB5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smcr8Q3UMB5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms