Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ceacam5Q3UKK2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ceacam5Q3UKK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ceacam5Q3UKK2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ceacam5Q3UKK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ceacam5Q3UKK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms