Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp2Q3UJK4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp2Q3UJK4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp2Q3UJK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms