Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHL1

Camkv, CaM kinase-like vesicle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CamkvQ3UHL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CamkvQ3UHL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CamkvQ3UHL1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CamkvQ3UHL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CamkvQ3UHL1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CamkvQ3UHL1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CamkvQ3UHL1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CamkvQ3UHL1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CamkvQ3UHL1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms