Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser2Q3UHI0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccser2Q3UHI0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccser2Q3UHI0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser2Q3UHI0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms