Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zswim8Q3UHH1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Zswim8Q3UHH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zswim8Q3UHH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zswim8Q3UHH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zswim8Q3UHH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms