Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brms1lQ3U1T3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1lQ3U1T3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brms1lQ3U1T3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1lQ3U1T3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brms1lQ3U1T3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brms1lQ3U1T3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms