Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam172aQ3TNH5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam172aQ3TNH5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam172aQ3TNH5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam172aQ3TNH5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms