Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc13Q3TIR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc13Q3TIR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc13Q3TIR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms