Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc127Q3TC33 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc127Q3TC33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc127Q3TC33 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc127Q3TC33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms