Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VrtnQ3SYK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VrtnQ3SYK4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VrtnQ3SYK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VrtnQ3SYK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VrtnQ3SYK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms