Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Specc1lQ2KN98 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Specc1lQ2KN98 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1lQ2KN98 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1lQ2KN98 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms