Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd84Q18PI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd84Q18PI6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd84Q18PI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd84Q18PI6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms