Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Traf3ip1Q149C2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf3ip1Q149C2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Traf3ip1Q149C2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Traf3ip1Q149C2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Traf3ip1Q149C2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
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