Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col19a1Q0VF58 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col19a1Q0VF58 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col19a1Q0VF58 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col19a1Q0VF58 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms