Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc138Q0VF22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc138Q0VF22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc138Q0VF22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms