Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd12Q0VE29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd12Q0VE29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Samd12Q0VE29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms