Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Kndc1Q0KK55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Kndc1Q0KK55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kndc1Q0KK55 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kndc1Q0KK55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Kndc1Q0KK55 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kndc1Q0KK55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms