Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf9Q07105 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf9Q07105 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf9Q07105 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf9Q07105 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms