Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf3Q07104 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf3Q07104 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf3Q07104 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms