Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrstQ06666 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrstQ06666 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrstQ06666 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrstQ06666 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrstQ06666 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrstQ06666 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrstQ06666 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrstQ06666 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrstQ06666 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrstQ06666 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrstQ06666 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms