Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl7Q03366 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl7Q03366 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccl7Q03366 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms