Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Runx1Q03347 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Runx1Q03347 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Runx1Q03347 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms