Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htr1fQ02284 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Htr1fQ02284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Htr1fQ02284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Htr1fQ02284 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms