Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa1Q00623 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa1Q00623 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa1Q00623 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa1Q00623 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms