Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx2Q00262 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx2Q00262 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx2Q00262 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx2Q00262 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms