Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca2P97929 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca2P97929 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Brca2P97929 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca2P97929 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca2P97929 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca2P97929 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca2P97929 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca2P97929 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brca2P97929 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brca2P97929 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brca2P97929 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms