Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad4P97471 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad4P97471 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad4P97471 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad4P97471 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad4P97471 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad4P97471 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad4P97471 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad4P97471 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad4P97471 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad4P97471 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad4P97471 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad4P97471 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad4P97471 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad4P97471 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad4P97471 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad4P97471 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad4P97471 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad4P97471 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms