Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Npas2P97460 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npas2P97460 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Npas2P97460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npas2P97460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npas2P97460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Npas2P97460 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Npas2P97460 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas2P97460 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas2P97460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Npas2P97460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas2P97460 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas2P97460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms