Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RhodP97348 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhodP97348 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhodP97348 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhodP97348 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhodP97348 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhodP97348 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhodP97348 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhodP97348 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhodP97348 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhodP97348 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RhodP97348 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhodP97348 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhodP97348 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhodP97348 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhodP97348 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhodP97348 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhodP97348 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhodP97348 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhodP97348 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhodP97348 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhodP97348 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhodP97348 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhodP97348 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RhodP97348 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhodP97348 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhodP97348 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhodP97348 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhodP97348 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhodP97348 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhodP97348 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhodP97348 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhodP97348 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhodP97348 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhodP97348 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhodP97348 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhodP97348 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RhodP97348 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhodP97348 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhodP97348 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhodP97348 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhodP97348 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhodP97348 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhodP97348 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhodP97348 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhodP97348 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhodP97348 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RhodP97348 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhodP97348 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhodP97348 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhodP97348 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RhodP97348 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhodP97348 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RhodP97348 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhodP97348 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhodP97348 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhodP97348 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RhodP97348 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhodP97348 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhodP97348 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhodP97348 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhodP97348 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhodP97348 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhodP97348 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhodP97348 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhodP97348 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhodP97348 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RhodP97348 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms