Protein–RNA interactions for Protein: P86174

Bend4, BEN domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend4P86174 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bend4P86174 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bend4P86174 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Bend4P86174 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bend4P86174 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bend4P86174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bend4P86174 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Bend4P86174 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bend4P86174 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bend4P86174 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Bend4P86174 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bend4P86174 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Bend4P86174 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bend4P86174 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Bend4P86174 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms