Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q6P79568 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q6P79568 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q6P79568 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q6P79568 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms