Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plxna3P70208 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plxna3P70208 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna3P70208 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna3P70208 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxna3P70208 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxna3P70208 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms