Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SbdsP70122 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SbdsP70122 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SbdsP70122 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SbdsP70122 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbdsP70122 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbdsP70122 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SbdsP70122 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbdsP70122 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SbdsP70122 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms