Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsc22d1P62500 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc22d1P62500 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsc22d1P62500 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsc22d1P62500 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms